این سازمان حقوق بشری در گزارش سال 2016 خود گفته است که تلاش‌های اصلاحی حکومت وحدت ملی افغانستان به دلیل ناتوانی آن در حل اختلافات داخلی و زیر کنترول درآوردن قدرتمندان محلی تضعیف گردیده است.

پاتریسیا گوسمن، محقق بخش افغانستان دیدبان حقوق بشر گفت: (حکومت وحدت ملی افغانستان فرصت‌های مهمی را برای رسیدگی به مشکلات جدی حقوق بشری از دست داده است.)

این سازمان گفته است که پول دهندگان بین المللی که کمک شان برای افغانستان به حیث یکی از فقیرترین اقتصادهای جهان حیاتی است، باید از نزدیک با مقام‌های افغانستان کار کنند تا اطمینان حاصل شود که دست‌آوردهای حقوق بشری بعد از سال 2001 از دست نمی‌روند.

دیدبان حقوق بشر در یک گزارش 659 صفحه‌ای فعالیت‌های حقوق بشری را در بیش از 90 کشور مورد ارزیابی قرار داده و تصویر تیره‌ای از وضعیت حقوق بشری در افغانستان 14 سال بعد از سقوط طالبان ارائه کرده است.

در گزارش آمده است که قتل بی‌رحمانه فرخنده ملک زاده، دختر 27 ساله افغان به اتهام بی‌اساس سوختاندن قرآن و محاکمه ناقص متهمان، واضحاً نشان دهنده ناکامی در تقویت حقوق زنان است، هرچند که حکومت به تکرار وعده تامین عدالت را داده بود.

در این گزارش همچنین به کشته شدن صدها فرد ملکی در نتیجه حملات انتحاری و بمب‌های کنار جاده یی اشاره کرده است. گفته شده است که شورشیان اسلامگرا قاضیان، سارنوالان، مقام‌های حکومتی و همچنین خبرنگاران و کارمندان امدادی افغان و خارجی را هدف قرار داده اند.

گزارش افزوده است که علاوه بر این، طالبان و دیگر گروه‌ها به شمول "دولت اسلامی" یا داعش مرتکب آدم ربایی و همچنین حملات "بی‌تفکیک" علیه مردم ملکی شده اند.

دیدبان حقوق بشر افزوده است که با وجود طرح برنامه عمل برای ازبین بردن شکنجه توسط نیروهای حکومتی و ملیشه‌ای، موارد ثبت شده شکنجه در سال 2015 افزایش یافته و گزارشی از پیگیری و تعقیب عاملان آن وجود نداشته است.

گوسمن گفت: (قساوت طالبان و دیگر شورشیان دست‌آویزی برای حکومت نیست که ملیشه‌های خشونتگر را استخدام کند یا نیروهای امنیتی را به دلیل خشونت به پاسخگویی نکشاند.)

در این گزارش همچنین به حادثه کندز اشاره شده است که در آن طیاره‌های جنگی امریکایی یک شفاخانه داکتران بدون مرز را بمباران کردند و 42 تن را به قتل رساندند.

دیدبان حقوق بشر گفته است که هرچند تحقیقات دریافته است که خطاهای "انسانی، طرز العمل کاری و فنی" باعث این بمباران شده است، اما سوال‌های زیادی راجع به این حادثه بی‌پاسخ مانده اند.